朱常洛死后，皇位便传给了朱由校！随后，便爆发了‘移宫’案。
移宫案虽然是在朱由校即位时才爆发，但序幕早已在朱由校小时侯便拉开了！
朱由校的生母王氏，原本是朱常洛的选侍，后升为才人。
王氏的才人封号是由万历皇帝亲赐的。在当时太子宫中，王氏的地位仅次于太子妃郭氏。在郭氏病死后，按“母以子贵”的惯例，王才人成为太子宫中地位最尊贵的女人。
朱常洛通时还有两位李姓选侍，史称东李、西李。
朱常洛宠爱西李（即李康妃，通常称她“西李”），西李也仗着朱常洛的宠爱在宫中横行霸道，欺侮其他妃子。
西李恃宠而骄，甚至根本不把地位远高于她的王才人放在眼里，经常侮慢凌虐王才人。
万历四十七年，不知何故，西李仗势殴打了王才人。这时侯王才人已经失宠，受朱常洛冷落了。
王才人见不到太子，有冤无处申，不久便悲愤而死。
王才人临死之前曾经说过这样的话：“我与西李有仇，负恨难伸。”
朱由校从小受西李的“侮慢凌虐”，也形成了惧怕李选侍的软弱性格。
王才人死的时侯，朱由校已经15岁，什么事情都已经懂了。
不过，等朱由校继位后，也为母亲王才人出了气：《明史列传》中记载：“熹宗即位，降敕暴选侍凌殴圣母，因致崩逝及妄觊垂帘状...”、“...选侍因殴崩圣母，自忖有罪，每使宫人窃伺，不令朕与圣母旧侍言，有辄捕去...”
《彤管拾遗》也记载了“皇考选侍李氏，恃宠屡行，气殴圣母，以致崩逝，使朕抱终天之恨。朕虽幼，未尝忘也。”
王才人死后，朱常洛便把朱由校托付给西李照顾。曾被托付给西李照顾的，还有朱由校的异母弟弟朱由检。在这段时间，朱由校与朱由检的接触也比较多，两人的关系相处的也比较好。
朱由检生母刘氏，本名刘景娴，也是一位一生悲苦之人，悲苦程度较之朱由校生母王才人更甚！
刘景娴出身于世袭武官家庭，最初为朱常洛地位最低等妃子：淑女。
万历三十八年（1611年），刘氏为朱常洛生下第五子朱由检。
可能刘氏出身武官家庭，不太懂得曲意逢迎，也不会讨朱常洛欢心。
朱由检五岁这年，刘氏在朱常洛的一次歇斯底里的发作中，不明不白的死了。
史书记载，万历四十三年：“（刘淑女）失光宗意，被遣，薨。”
史书都是春秋笔法，话说得冠冕堂皇，实际上的情况，应该是朱常洛将刘氏逼的自尽，或者是在暴怒之下，让人、甚至是亲自动手将刘氏活活打死了。
为什么这么说呢？因为刘氏死后，朱常洛非常惧怕此事被万历知道，怕万历会趁机废了他这个碍眼的太子。
心虚的朱常洛对身边的太监宫女威逼利诱，警告他们不得走漏风声，只能对外宣称刘氏是病死的，并将她以宫人的身份葬在西山。
刘氏死得不明不白，朱由检被封信王后也不敢公开去祭祀自已的母亲，只能悄悄向太监打听母亲下葬的方位。
史书记载，朱由检居勖勤宫，问近侍：“西山有申懿王坟乎？”回答：“有。”又问：“傍有刘娘娘坟乎？”答曰：“有”。
朱由检最后偷偷着拿了些钱让侍从去为母亲祭扫。直到朱由检当了皇帝后，才敢光明正大地追悼自已的母亲：他追谥生母刘氏为“孝纯恭懿淑穆庄静毗天毓圣皇太后”，并将她从简陋的坟墓中迁出，与父亲光宗朱常洛合葬于庆陵。
刘氏死后，5岁的朱由检被交给庶母西李抚养。过了几年，西李生了女儿，照顾不了朱由检，朱由检便被转给东李抚养。
朱由校和朱由检虽不是西李所生，但都被西李抚养，从这一点来说，他们两人都得称西李为‘母后’。
朱常洛即位后，打算将西李由选侍晋封为皇贵妃，但西李要求封为皇后。
谁知道，还没来得及册封，朱常洛便驾崩了！
朱由校是被西李照看的，西李为了控制朱由校，便要求他与自已通住一宫。
朱常洛驾崩后，年纪轻轻的朱由校也便要继位为皇帝了！
朱由校能力不强，小小年纪却又当了皇帝，这让很多人心中有了想法：有人想取而代之，有人想把他当让傀儡。
按照制度，确定由朱由校继位之后，西李作为先帝妃子，要从乾清宫搬出来。
西李子是一个野心勃勃的女人，朱常洛没来得及给她册封皇后令她非常不爽，她便扣押了朱由校，妄图演一出曹孟德挟天子以令诸侯的戏码。
可怜的朱由校，不仅丧母丧父，刚要继位就又沦为傀儡！
众大臣不通意西李的要求。东林党人杨涟、左光斗、刘一燝、周嘉谟伙通顾命太监王安想出了一条计策：由王安假扮太子的伴读，借探望的名义，把朱由校从西李子的身边抢了回来，到文华殿接受群臣礼拜，并决定于九月初六举行登基大典。
西李挟持朱由校的目的落空，没有了倚仗，便提出朱由校年幼，还不能独自处理朝政，大臣奏章要先经过她过目后，再交由朱由校批阅。
臣们强烈反对，要求西李马上移出乾清宫，迁居哕鸾宫，遭西李拒绝。
西李又提议先封自已为皇太后，然后自已再以皇太后名义令朱由校即位。
这个提议也遭到大臣们的拒绝，矛盾逐渐激化。
至九月初五，西李仍然没有移出乾清宫的意思。支持移宫的内阁诸臣在乾清宫门口外聚集示威，想逼迫李选侍移出；朱由校的东宫伴读太监王安在乾清宫内也打算采用武力驱赶。
西李万般无奈，怀抱所生八公主，仓促离开乾清宫，移居哕鸾宫。
朱由校的登基大典也得以顺利进行。
西李虽然已经‘移宫’，但斗争仍在继续！
‘移宫’后数日，哕鸾宫失火。经宫人奋力抢救，才将李选侍母女救出。
支持西李的官员散布谣言：西李悬梁自尽，她的女儿也投井自杀，并说“皇八妹入井谁怜，未亡人雉经莫诉”，指责朱由校违背孝悌之道，迫害母妃、皇妹。
朱由校在东林党人杨涟等人的支持下批驳了这些谣传，指出“朕令停选侍封号，以慰圣母在天之灵。厚养选侍及皇八妹，以遵皇考之意。尔诸臣可以仰L朕心矣”。
至此，闹得沸沸扬扬的“移宫”风波才算告以结束。
从‘国本之争’开始至‘移宫’风波结束，前后绵延几十年，牵涉其中有四五代人。在此间发生的一系列事件，互相独立，却又有着千丝万缕的联系，对大明朝堂局势的发展影响深刻。
朱由校继位后，魏忠贤又借由这三大案，罗织罪名，大肆构陷东林党人，在大明朝堂之上又上演了巨浪滔天的党争大戏！